公司保护中小投资者的方式有很多，以下是一些常见的方法：

1. 透明度和信息披露：公司应该提供准确、全面的信息，包括财务状况、经营策略、风险因素等，以便投资者能够做出明智的投资决策。公司应定期发布财务报告，并在必要时进行及时的信息披露。

2. 合规监管：公司应遵守相关的法律法规和规章制度，接受监管机构的监督和审查。公司应建立健全的内部控制和合规制度，以确保业务运作的合法性和合规性。

3. 投资者教育和沟通：公司应提供投资者教育和培训，帮助中小投资者了解投资风险和投资策略。同时，公司应积极与投资者进行沟通，回答他们的问题和关注，并及时提供相关的信息。

4. 投资者保护机制：公司应建立健全的投资者保护机制，包括投诉处理机制、争议解决机制等，以保护中小投资者的合法权益。公司应设立独立的投资者关系部门，负责处理投资者的投诉和建议。

5. 风险管理和投资策略：公司应建立有效的风险管理制度，包括风险评估、风险控制和风险应对等方面，以降低投资风险。同时，公司应制定明确的投资策略，避免过度风险集中和不必要的投机行为。

6. 公司治理和独立董事制度：公司应建立健全的公司治理结构，包括独立董事制度、董事会监督等。独立董事应对公司的决策和运营进行监督，确保中小投资者的利益得到保护。

总之，公司保护中小投资者的核心在于提供透明度和信息披露，遵守法律法规，进行投资者教育和沟通，建立投资者保护机制，进行风险管理和制定合理的投资策略，以及建立健全的公司治理结构。这些措施将有助于保护中小投资者的合法权益，提高市场的透明度和公平性。